По результатам оценки результативности научных организаций присвоена 2-я категория (приказ ФАНО России № 157 от 30.03.2018).
15 декабря 2023 г. к.б.н. Ирина Николаевна Шеховцова избрана директором ЦСБС СО РАН.
24 августа 2020 года д.б.н. Чепинога Виктор Владимирович избран директором ЦСБС СО РАН.
Центральный сибирский ботанический сад (ЦСБС) был создан в 1946 году в структуре Западно-Сибирского филиала АН СССР, в 1961 г. ему присвоен статус научно-исследовательского Института. До 1964 г. ЦСБС располагался в Заельцовском районе г. Новосибирска, занимал территорию в 232 га.
В 1964 г. для ЦСБС в окрестностях Академгородка была выделена территория в 1060 гектаров, на которой в соответствии с планом размещены коллекции и экспозиции растений - дендрарий,систематикум, полезных, редких и исчезающих видов растений.
В 1971 г. было закончено строительство главного лабораторного корпуса, производственных, технических помещений, и весь коллектив ЦСБС был перебазирован в Академгородок.
В 1982 г. состоялось официальное открытие Центрального сибирского ботанического сада, подведены итоги завершению строительства на новой территории.
В течение последнего десятилетия сад развивается как центр интеграции ботанических исследований в Сибири. При нем успешно функционируют Научный Совет ботанических садов Сибири, Совет по проблемам ботаники, Новосибирское отделение Русского Ботанического общества, Совет по защите докторских диссертаций.
В настоящее время в институте трудятся: академиков - 1, членов-корреспондентов - 1, докторов наук - 23, из них 8 имеют звание профессора, кандидатов наук - 74, научных сотрудников без степени - 27.
За 60 лет сотрудниками Центрального сибирского ботанического сада издано более 250 крупных монографий и книг, в том числе сводка "Флора Сибири" в 14-ти томах, "Зеленая книга Сибири", "Определители растений" и "Красные книги": Алтайского края, Кемеровской и Новосибирской областей, Республики Тыва, Ханты-Мансийского АО, опубликовано свыше 5,5 тыс. научных статей в журналах и сборниках, получено 98 авторских свидетельств и патентов на новые сорта растений, лечебные препараты, изобретения, десятки практических предложений используются в производстве.
Центральный сибирский ботанический сад имеет тесные связи со всеми ботаническими садами России и ближнего зарубежья, с 250 садами других стран пяти континентов. Гербарные коллекции достигли 860 тыс. листов высших сосудистых растений.
