Методы, технологии и инструментальные средства создания вычислительной инфраструктуры в Internet, комплексный интеграционный проект (ИВТ, ИДСТУ, ИМ, ИСЭМ СО РАН) № 3 СО РАН, 2003-2005,
Развитие методов управления нелинейными логико-динамическими системами, проект ИДСТУ СО РАН в рамках Программы фундаментальных исследований №19 Президиума РАН, 2003-2004,
Разработка основ моделирования и обеспечения устойчивости многокомпонентных машиностроительных систем при экстремальных условиях функционирования, проект ИДСТУ СО РАН (совместно с д.т.н., проф. А.Ф.Берманом) в рамках Программы ОЭММПУ РАН, 2003,
Методы динамики систем и управления для нелинейных гибридных систем с неопределенностями, ИДСТУ СО РАН, 2002-2004,
Автоматизация логического вывода для обработки динамических знаний в задачах управления пространственно-распределенными системами, ИДСТУ СО РАН, 2002-2004,
Математическое моделирование и задачи устойчивого развития для социально-эколого-экономических систем в Байкальском регионе, ИДСТУ СО РАН, 2002-2004,
Методы автоматизации исследования и разработки интеллектных систем, ИДСТУ СО РАН, с 1999,
Математическое моделирование окружающей среды и влияние антропогенной деятельности на природу Байкальского региона, ИДСТУ СО РАН, 1999-2001,
Разработка качественных методов нелинейной динамики и управления для сложных систем с разнородным математическим описанием, ИДСТУ СО РАН, 1999-2001,
Методы и технологии разработки и использования гибридных экспертных систем вычислительного типа в области математического моделирования и исследования динамики сложных управляемых движущихся объектов, ИрВЦ СО РАН, 1996-1998,
Методы анализа, управления и математического моделирования логико-динамических систем, ИрВЦ СО РАН, 1996-2001,
Модели и методы устойчивого развития, ИрВЦ СО РАН, с 1996,
Системный анализ и технология математического моделирования и управления динамикой экологических и эколого-экономических систем, ИрВЦ СО РАН, с 1995 (в сотрудничестве с ак. АНТ Т.К.Сиразетдиновым, КГТУ),
Исследование проблемы и разработка интеллектуализированной системы автоматического синтеза расчетных схем, вывода и анализа уравнений движения для управляемых крупногабаритных космических конструкций, ИрВЦ СО РАН, 1995.
