Федеральный Алтайский научный центр агробиотехнологий создан на базе Алтайского НИИ сельского хозяйства в форме присоединения к нему пяти научных организаций:
• Всероссийский научно-исследовательский институт пантового оленеводства;
• Научно-исследовательский институт садоводства Сибири имени М.А. Лисавенко;
• Сибирский научно-исследовательский институт сыроделия;
• Горно-Алтайский научно-исследовательский институт сельского хозяйства;
• Алтайский научно-исследовательский институт животноводства и ветеринарии.